تتكوّن الأمانة العامة من الأجهزة التالية:
- أمين عام
- مساعد أمين عام أو أكثر
- هيئة مكتب
مهام الأمانة العامة
تقوم الأمانة العامة بالأعمال المتعلقة بأهداف المجلس المنصوص عنها، في المادة 4 من هذا النظام ومن أبرزها المهمات التالية:
- تتولى الأمانة العامة بواسطة كفاءات مختصّة مهمّة جمع المعلومات والوثائق وتبويبها، غاية استقراء التوصيات ووضع البرامج المستقبلية.
- تعنى الأمانة العامة بالاتصالات مع الهيئات العامة والخاصة ولاسيّما المراجع الرومانية والمسكونية والمجالس الأسقفية وسائر الهيئات التي تتلاقى أهدافها وأعمالها مع أهداف المجلس وأعماله.
- تمارس الأمانة العامة صلاحياتها وتتمّ أعمالها بإشراف مجلس الرئاسة ومن خلال مشاركتها بأعمال الهيئة التنفيذية.
- تقوم الأمانة العامة بالأعمال اللازمة من أجل ضمان حسن سير أعمال المجلس وهيئاته ولجانه وفرق عمله وأجهزته.